Золотой стандарт: какой из тестов на коронавирус наиболее точен?
Тестирование как способ установить присутствие вируса в организме используют давно. Но широкое применение этот метод получил с приходом нового коронавируса: отлаженная система массового тестирования необходима, чтобы контролировать уровень заболеваемости. О существующих на сегодняшний день тест-системах и их возможностях «Таким делам» рассказал генеральный директор центра молекулярно-генетических исследований «ДНКОМ» Андрей Исаев.
Какие сейчас в России и мире применяют тесты на выявление коронавируса и чем они отличаются?
Диагностические тест-системы позволяют установить присутствие вируса в организме. У них есть два варианта результата: положительный — возбудитель обнаружен, отрицательный — не обнаружен. Очень важно, что положительный результат может быть получен и при отсутствии клинической симптоматики.
Существуют две основные группы тестов, которые отличаются по используемому методу.
Молекулярно-биологический аналитический метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) — золотой стандарт при различных инфекционных болезнях. Метод ПЦР позволяет воспроизводить кусочек ДНК, многократно увеличивая его концентрацию, и тем самым выявлять даже единичные бактерии и вирусы. Это исследование применяется в подавляющем большинстве случаев во многих странах мира. Оно позволяет верифицировать генетический материал возбудителя заболевания и узнать, чем конкретно болен человек.
ПЦР — это прямой метод выявления возбудителя. Но есть также косвенный метод, который сегодня набирает популярность, — это определение антигенов SARS-CoV-2 в мазках, которые можно сделать без визита в лабораторию. Антиген — это любой чужеродный материал, пришедший извне.
В ПЦР-тестах ищут РНК вируса, а экспресс-тесты на антиген выявляют белки вируса, которые связываются с приемным буфером. Если антиген вируса присутствует в пробе, на тестовой кассете проявится вторая полоска. Все системы с тест-полосками называются хроматографическими. Наиболее известны из них системы для определения беременности.
В аптеках также можно найти экспресс-тесты на выявление антигена по крови. Там также используется тест-кассета с полосками, но в качестве исследуемого материала берется капля крови из пальца.
Какие из тестов наиболее точны? Почему преимущество отдается ПЦР-тестам?
В рекомендациях Минздрава оговаривается, что для диагностики можно использовать ПЦР-исследование и антиген-тесты. Достоинство антиген-тестов — быстрота их выполнения, что важно для принятия оперативных мер. Минус — существенно более низкая, чем у ПЦР-тестов, точность и чувствительность.
ПЦР-тесты способны выявлять даже единичные бактерии и вирусы. Поэтому они более предпочтительны для принятия решения о самоизоляции или лечении. При этом новая технология ПЦР LAMP позволяет выдавать результат за 45 минут. За счет биохимических особенностей процесса это более быстрый и простой тест. Благодаря высокой технологичности в нем отсутствуют некоторые этапы, предусмотренные в классической технологии ПЦР-тестирования.
С другой стороны, если ПЦР-тесты могут еще долго определять минимальные остаточные концентрации РНК вируса, положительный результат антиген-теста говорит о высокой концентрации вируса в верхних дыхательных путях и заразности человека в данный момент. Кроме того, индивидуальные антиген-тесты, которые позволяют получать результат в течение нескольких минут, могут быть актуальны в бытовом плане.
Что касается экспресс-тестов на определение антигена по крови, то это достаточно бессмысленная технология. В крови вирус определяется только на очень тяжелой стадии болезни, когда уже и так все ясно.
Можно ли брать для ПЦР-тестов слюну?
Появились исследования, согласно которым омикрон лучше определяется в слюне, а не в мазках из носоглотки.
О том, что при инфицировании омикроном вирус в большей степени концентрируется в слюне, сообщили ученые Университета Кейптауна (ЮАР). По их данным, этот штамм в мазках из носоглотки обнаруживается только в 86% случаев, притом что в слюне он определялся в 100%.
Для штамма дельта результаты были обратные: в слюне он обнаруживался только в 71% случаев, в носоглотке — в 100%. Исследователи из ЮАР сделали вывод, что принятый стандарт диагностики не лучшим способом подходит для выявления омикрона.
Между тем вирионы находятся внутри клетки, поэтому для ПЦР-исследования берется соскоб эпителия. В России по приказу Минздрава мазок на ковид всегда собирается из горла и носоглотки.
Что показывает опыт применения быстрых антиген-тестов в РФ и за рубежом и каково их влияние на борьбу с пандемией?
У антиген-тестов есть своя ниша. Хотя у них и низкая чувствительность, экспресс-тесты могут быть полезны в том случае, если нужно поставить диагноз в отдаленном населенном пункте, в тундре или на буровой вышке, где нет возможности провести ПЦР-диагностику. Если клинические проявления уже довольно выражены, тест на антиген может показать наличие вируса.
Но из-за того, что российские компании поздно начали производить такие системы, в нашей стране цена на антиген приближается к стоимости ПЦР. Поэтому в российских условиях теряется смысл использования антигенных тестирований, кроме случаев, когда ПЦР-тест недоступен.
Как можно объяснить тот факт, что, когда врач из поликлиники берет сразу два анализа, антиген-тест может показать положительный результат, а ПЦР — отрицательный? Это относится именно к омикрону?
Вопрос не в том, что ПЦР плохо определяет омикрон или другой штамм, а в том, что в городских поликлиниках используются неподходящие расходные материалы. Там, где материал берется корректно, такого не происходит.
ДНКОМ сейчас начинает работать с московским здравоохранением и планировал принимать биоматериал для анализов в расходниках из поликлиник. Но привезенные на днях в лабораторию первые пробы никуда не годятся: вместо эппендорфов и зондов для взятия мазков были использованы зонды с ватой на конце и неподходящие пробирки.
Вирус лучше всего определяется в эпителиальных клетках, а при использовании таких зондов эти клетки застревают в вате, их оттуда невозможно нормально выделить. Поэтому столько отрицательных проб ПЦР в поликлиниках.
Так что проблема точности поликлинических ПЦР-тестов — в расходниках. А тест на антиген врачи поликлиники берут нормальным расходником, который идет в комплекте, и получают положительный результат.
Сегодня, если ПЦР-тест отрицательный, а антиген-тест положительный, пациента все равно отправляют на самоизоляцию. Почему тогда не выдают по результатам антиген-теста QR-коды?
Разговоры о том, что нужно выдавать QR-код в том числе и по антигену, ведутся. Но проблема в том, что за этими исследованиями не стоит мощной системы верификации.
При ПЦР-исследовании есть протокол, прибор, на котором проводится анализ, хранятся отчеты о ходе его работы, в любой момент можно поднять пробу и переделать ее. В случае с антиген-тестом непонятна его воспроизводимость, кто отвечает за верность результата — неясно.
Чтобы не плодить фейковых данных, идеи с выдачей QR-кодов по антигену пока тормозятся. Кроме того, эффективность этих двух тестов никогда не сможет сравняться даже по чисто технологическим причинам. Поэтому золотым стандартом диагностики все-таки остается ПЦР-исследование.
Каждый день мы пишем о самых важных проблемах в нашей стране и предлагаем способы их решения. За девять лет мы собрали 300 миллионов рублей в пользу проверенных благотворительных организаций.
«Такие дела» существуют благодаря пожертвованиям: с их помощью мы оплачиваем работу авторов, фотографов и редакторов, ездим в командировки и проводим исследования. Мы просим вас оформить пожертвование в поддержку проекта. Любая помощь, особенно если она регулярная, помогает нам работать.
Оформив регулярное пожертвование на сумму от 500 рублей, вы сможете присоединиться к «Таким друзьям» — сообществу близких по духу людей. Здесь вас ждут мастер-классы и воркшопы, общение с редакцией, обсуждение текстов и встречи с их героями.
Станьте частью перемен — оформите ежемесячное пожертвование. Спасибо, что вы с нами!
Помочь нам